In der Sammlung Gegenwartskunst überwiegt eine sachliche, objektive und konzeptuelle künstlerische Haltung. Neben der dokumentarischen Praxis des Künstlerpaares Bernd (1931–2007) und Hilla (1934–2015) Becher gehören einflussreiche Positionen der seriellen und projektbezogenen Fotografie zur Museumssammlung.
Des Weiteren besitzt das MGKSiegen wichtige Arbeiten der Video- und Installationskunst. Der Fokus liegt auch hier auf jenen Künstler*innen, die während der 1960er Jahre die Gattungsgrenzen aufbrachen. Ihnen sind Arbeiten jüngerer Künstler*innen zur Seite gestellt, die mit ähnlichen künstlerischen Praktiken die Gegenwart befragen.
Einen weiteren Schwerpunkt der Sammlung bilden die Werke und Werkgruppen von Peter Piller, Diango Hernández, Vajiko Chachkhiani und Lena Henke, die den Förderpreis zum Rubenspreis der Stadt Siegen erhielten.
